Trong trận chiến bùng nổ bất ngờ này, Hoàng Siêu phân tách vô số tâm thần để chiến đấu tại nhiều địa điểm khác nhau.
Ba chiếc chiến hạm tấn công tối tân nơi Trương Hạo đang chỉ huy nhận được thông điệp từ Hoàng Siêu. Hình ảnh của anh xuất hiện trên màn hình hiển thị của họ: "Xuyên qua chiến tuyến, lập tức tiến về phía thành phố máy móc."
Giữa chiến trường khốc liệt, ba chiếc chiến hạm tách khỏi đội hình, lao thẳng vào đám đông máy móc hình mực ống. Những người trên tàu đều nín thở kinh hãi, nhưng kỳ lạ thay, không có chuyện gì xảy ra cả. Họ hòa mình vào đội quân quái vật cơ khí, lũ mực ống tự động dạt sang hai bên nhường đường.
Việc Hoàng Siêu làm rất đơn giản: anh đã thiết lập hệ thống định danh ba con tàu này là quân đồng minh.
Hoàng Siêu siết chặt tay, kết liễu một đặc vụ. Gã đặc vụ co giật vài cái trên tay anh rồi hoàn toàn tan biến, hóa thành những mảnh dữ liệu vụn vỡ. Cùng lúc đó, đỉnh một ngọn đồi nhỏ gần đó bất ngờ nổ tung. Vụ nổ trông không quá nghiêm trọng, nhưng khu vực xung quanh lại xuất hiện hiện tượng biến dạng không gian.
"Tốt, đến địa điểm tiếp theo thôi." Hoàng Siêu bay vút lên, hướng tới một nút thắt khác của Ma Trận. Phía sau anh, trong những ngọn đồi, tiếng nổ và ánh lửa liên tục bùng lên. Các đặc vụ trong khu vực này đều đã bị anh tiêu diệt sạch sẽ, điều này giúp công việc của những người khác trở nên trôi chảy hơn nhiều.
Ý thức của Hoàng Siêu kết nối với hàng ngàn con mực ống đang lao tới trong một đợt tấn công tập trung. Anh ra lệnh "đình trệ", khiến lũ mực ống khựng lại, bỏ lỡ những chiếc phi cơ đang cạn kiệt xung đột điện từ trước mặt. Ngay khoảnh khắc tiếp theo, những kẻ tấn công mới đã ập đến. "Ầm! Xẹt xẹt!" – xung điện từ càn quét toàn bộ nhóm mực ống này.
Những phi cơ quay trở về hạ cánh, mọi người ôm chầm lấy đồng đội ăn mừng, đồng thời nạp lại xung điện từ để chuẩn bị cho đợt xuất kích mới.
"Cứ như thể ông trời đang che chở cho chúng ta vậy. Mực ống sắp lao tới trước mặt rồi mà chúng lại khựng lại, rồi tự động trượt sang hai bên. Không biết họ đã làm cách nào để phá hủy trung tâm chỉ huy của lũ máy móc đó nhỉ." Mọi người bàn tán về vận may của mình, khiến cuộc chiến bớt đi phần nào sự đáng sợ.
May mắn thì có nhiều, nhưng nếu ai cũng có thể trở về an toàn sau những đợt tấn công xung điện thì đó không chỉ là may mắn nữa. Tại căn cứ, Hoàng Siêu nhận được câu hỏi từ chỉ huy Vương Kiệt: "Lần nào lũ mực ống cũng tránh né con người, đến giờ chúng ta vẫn chưa có thương vong nào. Tất cả những sự trùng hợp đó, đều là do cậu làm sao?"
Hoàng Siêu cười đáp: "Chắc là do ông trời phù hộ thôi."
Vương Kiệt im lặng hồi lâu rồi lên tiếng: "Tôi luôn cảm thấy chuyện Zion bị lừa dối bởi lời nói dối về Đấng Cứu Thế là nực cười, nhưng giờ tôi bắt đầu tin rồi. Thật vui mừng khi biết Đấng Cứu Thế cũng là người của chúng ta."
Hoàng Siêu cùng Morpheus và những người khác thực hiện kế hoạch đánh bom trạm điện, tiến vào tòa nhà dẫn tới nguồn gốc của vạn vật. Người Giữ Chìa Khóa mở cho họ một cánh cửa dẫn vào hành lang cửa sau.
Morpheus giữ vẻ mặt nghiêm nghị, bước vào hành lang trắng xóa trước tiên. Hoàng Siêu cũng bước vào với vẻ mặt thản nhiên, không hề tỏ ra ngạc nhiên chút nào.
Dù rằng lúc này, ở một phía khác, anh vừa tình cờ chạm mặt Nhà Tiên Tri.
Hoàng Siêu ở phía đó nở một nụ cười dữ dằn, giống hệt Smith, nói với Nhà Tiên Tri đang chặn đường mình: "Cuối cùng tôi cũng được gặp nhân vật huyền thoại là Nhà Tiên Tri, quả là một cuộc gặp gỡ thú vị. Chẳng phải bà vẫn luôn trốn tránh tôi sao? Điều gì đã khiến bà dám đứng trước mặt tôi thế này?"
Hoàng Siêu-Smith cùng chung một chiến tuyến, và ở đây có rất nhiều phân thân Hoàng Siêu-Smith. Họ vẫn giữ diện mạo của đặc vụ Smith, học theo cách nói chuyện ngạo mạn, đáng ghét của gã.
Nhà Tiên Tri không hề nghi ngờ. Sau vài câu mỉa mai qua lại, Nhà Tiên Tri nói: "Ra tay đi."
Hoàng Siêu biết Nhà Tiên Tri thực chất đang cố tình chịu chết. Bà bị Smith lây nhiễm nhưng sẽ không chết, ngược lại Smith sẽ trở nên mạnh mẽ hơn. Đấng Tạo Hóa không thể kiểm soát được điều đó, chỉ có thể thỏa hiệp với Neo, hứa sẽ không tiêu diệt Zion nữa. Đến lúc đó, Neo sẽ hy sinh bản thân để cứu vãn Ma Trận, còn Nhà Tiên Tri trở thành người chiến thắng lớn nhất. Ma Trận, người máy, các chương trình thông minh từ nay sẽ phát triển theo lộ trình của bà. Bà cũng đã giúp đỡ con người, đồng thời có thể giải phóng những người "không muốn ở lại" trong Ma Trận.
Hoàng Siêu cắm tay vào cổ tay Nhà Tiên Tri, bùn đen trào ra bao phủ lấy bà, bà biến thành một Smith khác. Trong sâu thẳm Ma Trận, cuộc chiến mới chỉ bắt đầu. Mọi ý thức của Hoàng Siêu trong khoảnh khắc này đều khựng lại; Nhà Tiên Tri đã sắp đặt những bố cục cực kỳ phức tạp bên trong Ma Trận.
Ma Trận càng hỗn loạn, thế giới tinh thần của Hoàng Siêu càng bao phủ nhiều hơn. Cho đến tận bây giờ, cả Đấng Tạo Hóa và Nhà Tiên Tri vẫn tưởng rằng đây chỉ là chương trình Smith của thời không này.
Trong hành lang, Hoàng Siêu thoáng chốc mất tập trung. Morpheus nghe thấy anh dừng bước, quay đầu lại hỏi đầy nghi hoặc: "Neo, cậu vẫn ổn chứ?" Hoàng Siêu nở một nụ cười trấn an: "Không sao."
Họ tiếp tục tiến lên, trong hành lang không có ai ngăn cản, cả ba thuận lợi tiến vào cuối hành lang.
Người Giữ Chìa Khóa tháo một chiếc chìa khóa từ cổ xuống đưa cho Hoàng Siêu: "Đây là thứ thuộc về cậu, cậu biết là cánh cửa nào rồi đấy." Anh ta lại chỉ vào một cánh cửa khác, nói với Morpheus: "Morpheus, cánh cửa đó sẽ đưa ông về nhà."
Hoàng Siêu đứng trước cửa, trong tầm nhìn mã hóa, cánh cửa này tỏa ra ánh sáng bất thường. Đôi mắt sau cặp kính râm của Hoàng Siêu lóe lên tia cười, anh cắm chìa khóa vào ổ, chậm rãi vặn mở. Ánh sáng trắng rực rỡ bắn ra từ khe cửa, cuối cùng nuốt chửng lấy anh hoàn toàn.
Hoàng Siêu bước vào một không gian tràn ngập màn hình hiển thị. Trước mặt anh, một chiếc ghế văn phòng vốn đang quay lưng lại bỗng xoay chuyển, trên đó là một ông lão mặc bộ vest trắng.
"Chào cậu, Neo."
"Xin lỗi, ông nhận nhầm người rồi." Hoàng Siêu thản nhiên nói.
Đại Đế Máy Móc đã tính toán mọi khả năng trả lời của Hoàng Siêu và hiển thị lần lượt trên các màn hình xung quanh nhằm tạo áp lực tâm lý. Nhưng hắn lại không hề hiển thị câu trả lời này! Bởi xác suất của câu trả lời đó quá nhỏ, mà số lượng màn hình trên tường lại có hạn.
"Tha lỗi cho tôi, cậu đang nói gì vậy?" Đấng Tạo Hóa, tức là Đại Đế Máy Móc, đã vận hành "Sự kiện Đấng Cứu Thế" năm lần rồi, chưa bao giờ nghĩ rằng Đấng Cứu Thế lại nói với mình như vậy.
"Ta là Đấng Tạo Hóa, ta đã xây dựng nên Ma Trận." Hắn không cho Hoàng Siêu cơ hội trả lời, trực tiếp giới thiệu bản thân nhằm giành thế chủ động trong cuộc đối thoại. Hắn vừa định nói tiếp thì Hoàng Siêu giơ một tay lên: "Xin lỗi vì ngắt lời ông, những điều này tôi đều đã biết cả rồi. Chào ông, tôi là Hoàng Siêu."
Kể từ khi Đại Đế Máy Móc xây dựng các tầng ruộng bậc thang pin người, cứ khoảng hai ba mươi năm lại xuất hiện vấn đề nghiêm trọng – đây cũng chính là khoảng thời gian một thế hệ trưởng thành. Mỗi chu kỳ đều sẽ có người thức tỉnh năng lực đặc biệt. Những người thức tỉnh luôn là những thanh niên ở độ tuổi của Neo, những người mang tư tưởng nổi loạn. Đây là yếu tố bất thường do Ma Trận dung hợp sức mạnh tinh thần của con người gây ra, cũng có thể coi là điềm báo cho thấy Đại Đế Máy Móc không còn khí vận, định sẵn sẽ bị lật đổ.
Vì lý do này, Đại Đế Máy Móc đã thiết lập Zion để dẫn dắt những yếu tố bất thường đó, ép họ phải hy sinh bản thân vào cuối cùng, quay trở về nguồn gốc của vạn vật và trả lại những mã code mà họ đã mang ra khỏi Ma Trận. Zion chính là công cụ chuyên dùng để đe dọa Đấng Cứu Thế vào những thời điểm như vậy.
Mỗi lần như thế, người Zion đều sẽ bị giết sạch, Đại Đế Máy Móc sẽ giữ đúng lời hứa, cử hai mươi ba người đi xây dựng lại Zion. Sau đó là một vòng lặp dối trá mới. Việc Đại Đế Máy Móc tạo ra trải nghiệm cho con người rất đơn giản, chỉ là một thế giới ảo nhỏ. Hắn sẽ giải phóng những người bên trong, những người đó sẽ được đưa đến Zion, họ sẽ tưởng rằng mình đã chiến đấu suốt nhiều năm trời...
Qua hai ba mươi năm, một sự bất thường mới lại xảy ra.